山本博之 / やまもとひろゆき / Hiroyuki Yamamoto / 連絡先 h.yama2396@gmail.com / google scholar /
研究業績 / 山形県鶴岡市 (大阪→京都→神戸→鶴岡→川崎→鶴岡) / 会社員 / 社会科学のデータサイエンス研究 / AIアプリ開発記録(生命科学) /
メタボロミクスのインフォマティクス・データサイエンスに関する研究活動に取り組んでいます。
特に、多変量解析、エンリッチメント解析、デコンボリューション、AIによる自動化を中心に研究を進めています。
オミックスデータの多変量解析
- 多変量解析を用いたメタボロームデータ解析
- 参考資料
- 多変量解析を用いたオミックスデータ解析のためのRパッケージloadingsの開発 @ Bio”Pack”athon2024#9
解説動画 /
スライド
- 多変量解析を用いたメタボロームデータ解析（2018）@ 第2回質量分析インフォマティクス・ハッカソン（2018）
解説動画 /
スライド
- 多変量解析の背景理論の説明 @ D-STEP講習会（メタボロミクスソフトウェア講習会、2018）
解説動画
バイオデータベース活用
- エンリッチメント解析
- リポジトリデータ再解析(データ収集)
- 参考資料
- 検出されない代謝物を考慮したエンリッチメント解析 @ Bio”Pack”athon2025#6 解説動画 / スライド
- 山本博之, "多変量解析，エンリッチメント解析，代謝マップ描画", メタボロミクス実践ガイド, 羊土社, 2021. ( link )
質量分析インフォマティクス (研究会)
- 質量分析インフォマティクス研究会
- 年1回の研究会ワークショップのほか、ソフトウェア講習会やハッカソンなどのイベントを開催しています。
- 質量分析インフォマティクス研究会 2020年ワークショップ 開催報告 ( link )
- 参考資料
- メタボロミクスにおける「質量分析インフォマティクス」 ( link )
- プロダクトイオンスペクトル情報を利用した機械学習研究 ( link )
行列分解(デコンボリューション)
- MS/MSデコンボリューションのためのMS2DecRを開発しています。
- MS-DIAL likeな方法と、MCR-ALSを使った方法を実装しています。
- 参考資料
- MCR-ALSによるデコンボリューション @ Bio”Pack”athon2026#8 解説動画 / スライド
AIによるデータ処理自動化